Toàn bộ địa giới hành chính thành phố Long Xuyên bao gồm 11 phường và 2 xã với quy mô diện tích tự nhiên là 11.536,44 ha. Có tứ cận như sau:
- Phía Đông giáp huyện Chợ Mới.
- Phía Tây giáp huyện Thoại Sơn.
- Phía Nam giáp thành phố Cần Thơ.
- Phía Bắc giáp huyện Châu Thành.